印尼外交部部长雷诺马尔苏迪（Retno Marsudi）2月2日下午向媒体宣布，印尼政府禁止中国护照持有者入境或者转机印尼，对于在14天之内到过中国的外国人同样适用，该禁令于2月5日凌晨开始执行。印尼政府同时也暂停向中国大陆公民授予落地签证和免签的政策。
根据该禁令，2月5日零时起停止中国与印尼之间全部直飞航班。记者联系到中国国航、东方航空、印尼狮航的相关负责人，称前往印尼的直飞航班均已陆续停飞。据印尼鹰航航班信息显示，2月4日是最后一班出港航班。复飞时间要等进一步通知。
2月4日晚23：30东方航空最后一班航班将从巴厘岛飞往上海浦东。南方航空雅加达至广州原2月5日航班，也将提前至2月4日晚上，具体调整为：原起降时间：2月5日09:05–15:25，新起降时间：2月4日 22:30–04:50 +1。（以上均为当地时间。）
就滞留国外的部分中国游客的去留及签证问题，印度尼西亚旅游与创意经济部大中华区司长文森·修斯杰马杜(Vinsensius Jemadu)在接受记者采访时表示，“持中国护照的游客，在30天签证到期之前，可经由旅行社或直接向当地政府申请延期，印尼政府也将全力给予协助和便利。”据印尼司法与人权部法令，外国公民在不可抗力的条件下可延期签证，包括： a.人道危机b.自然灾害c被印尼政府驱逐惩罚后在离开印尼之前d.在印尼接受司法案件的调查e.在印尼取保候审或监视居住。其中在a和b的情况下当事人可以获得每次延期30天的停留期限，在c和d的情况下当事人可以获得每次延期6个月的停留期限。
本次疫情属于自然灾害，满足b类不可抗力条件，中国大陆护照持有者如下即将滞期的签证均可被延期，包括免签、落地签、已经延期四次的商务签证、即将到期的工作签证，学生签证和探亲签证以及其他签证类型。这些签证将获得每次延期30天，直至印尼政府解除对疫情封锁。
据当地旅行社介绍，不同代办服务公司收费不同，延期签证申请费用约合人民币在700-2000元不等。
对于滞留印尼想要返回中国的游客，还可以选择从马来西亚、泰国、或越南转机返回国内，印尼经停新加坡、韩国、香港到达中国的航班均已停飞。